Desde a morte de seus pais, Shinpei Ajiro morava com a família Kofune e suas duas filhas – Mio e Ushio. Embora ele tenha deixado sua ilha natal para continuar seus estudos em Tóquio, Shinpei retorna depois que Ushio se afoga tragicamente durante a tentativa de resgate de uma menina. Durante o funeral, seu melhor amigo informa sobre os hematomas encontrados no pescoço de Ushio, lançando dúvidas sobre a causa de sua morte. Suspeitando da ocorrência de um assassinato, Shinpei reavalia os acontecimentos recentes, mas incidentes estranhos continuam a acontecer. Pessoas desaparecidas e outras ocorrências inexplicáveis ​​levam Mio a relembrar um antigo conto popular referente a entidades chamadas “Sombras”, que pode não ser inteiramente fantasia. Supostamente, um encontro com a Sombra prediz a morte iminente da pessoa. Enfrentando o lado negro da Ilha de Hitogashima, Shinpei resiste ao seu destino sombrio para cumprir a vontade final de Ushio: proteger Mio.