Os preparativos para uma nova ofensiva contra os Neuroi – uma raça misteriosa de invasores alienígenas – estão bem encaminhados. O objectivo é garantir Berlim, a capital do Império de Karlsland, que é necessária para eliminar a ameaça Neuroi da Europa. No entanto, como o inimigo é capaz de se adaptar diariamente ao campo de batalha, as forças aliadas e o estado atual da tecnologia do Striker podem não ser suficientes para alcançar uma vitória. Enquanto isso, Yoshika Miyafuji, uma bruxa de Fuso, continua seus estudos de medicina em Lausanne. Tendo se recuperado de um incidente recente que a privou de poder mágico, ela está ansiosa para ajudar no esforço de guerra. O chamado às armas logo chega e as bruxas dispersas da 501ª Joint Fighter Wing devem ser reunidas mais uma vez para um ataque final contra o inimigo.