Nagisa Aoi começa sua nova vida escolar como estudante transferida na St. Miator's Girls Academy, uma das três prestigiadas instituições só para meninas no topo de Astraea Hill. Perdendo-se no primeiro dia, Nagisa encontra uma estudante misteriosa cuja elegância e charme são tão fascinantes que ela acaba na enfermaria. Lá para cumprimentá-la quando ela acordar está Tamao Suzumi, seu colega de quarto, que apresenta com entusiasmo a Nagisa a vida cotidiana e a estrutura social do campus. Mais notavelmente, Tamao a informa da existência de um representante estudantil excepcional entre as três escolas - o Etoile, ou "estrela". Ansiosa para conhecer essa pessoa, Nagisa descobre que a beleza etérea que conheceu antes, Shizuma Hanazono, é a única Etoile! Além disso, Shizuma parece abertamente interessado em Nagisa! Suas interações com Shizuma naturalmente fazem dela um tema quente no campus; no entanto, apesar de estar tão cativada, Nagisa não consegue evitar de se perguntar se algo está errado. Pânico de morango!segue as rotinas diárias de Nagisa, Shizuma e seus amigos em St. Miator's, St. Spica e St. Lulim enquanto eles navegam pelo desafio dos relacionamentos enquanto enfrentam sentimentos ocultos, arrependimentos persistentes e novas possibilidades.