Conta a histria dos arteses estudantes de uma Escola Tcnica Shinigami. Death City é o lar da famosa Death Weapon Meister Academy, uma academia técnica liderada pelo Shinigami – o próprio Lord Death. Sua missão: criar "Foices da Morte" para os Shinigami usarem contra os muitos males de seu mundo fantástico. Essas Foices da Morte, entretanto, não são feitas de armas físicas; em vez disso, eles nascem de híbridos humanos que têm a capacidade de transformar seus corpos em armas demoníacas, e somente depois de terem consumido as almas de 99 seres malignos e a alma de uma bruxa. Soul Eater Evans, um Demon Scythe que só parece se importar com o que é legal, pretende se tornar um Death Scythe com a ajuda de seu manejador certinho, ou meister, Maka Albarn. A dupla contrastante trabalha e estuda ao lado do cabeça quente Black☆Star e sua carinhosa arma Tsubaki, bem como do próprio filho do Shinigami, Death the Kid, um manejador duplo obsessivo-compulsivo de pistolas gêmeas Patty e Liz. Soul Eater segue esses estudantes de Shibusen enquanto eles assumem missões para coletar almas e proteger a cidade das ameaças do mundo enquanto trabalham juntos sob o sol escaldante para se tornarem mais saudáveis ​​em mente, corpo e alma.