A Ilha Nanae é uma ilha artificial no Oceano Pacífico que contém tudo o que é necessário para a educação e formação adequadas das crianças. Foi criado pelos Grandes Sete, grupo de aventureiros liderados por Nanana Ryuugajou, como um lugar para os jovens perseguirem seus sonhos. Após ser renegado e exilado por sua família, o estudante Juugo Yama chega a esta ilha, feliz por finalmente estar livre de seu pai. Ao se mudar para seu novo quarto, ele descobre o fantasma de Nanana Ryuugajou, presa à ilha após seu assassinato não resolvido há 10 anos. Nanana conta a Juugo que, pouco antes de sua morte, ela escondeu itens com poderes únicos e misteriosos por toda a ilha – itens conhecidos como Coleção Nanana. Na esperança de descobrir pistas que o ajudem a encontrar o culpado por sua morte, Juugo, com a ajuda do autoproclamado "Mestre Detetive" Tensai Ikkyuu e sua empregada travesti Daruku Hoshino, parte em sua busca.