O alegre Yuuki Cross e o rude Zero Kiryuu são membros do comitê disciplinar da Cross Academy, que abriga duas turmas bem distintas: a Turma Diurna e a Turma Noturna. Seu trabalho consiste em manter a ordem entre as classes quando elas mudam. Embora isso possa não parecer uma tarefa especialmente difícil, a turma diurna desconhece a verdade por trás da turma noturna: seus lindos alunos são vampiros. Dez anos atrás, Yuuki foi salvo de um ataque de vampiro por Kaname Kuran, um vampiro sangue puro. Agora, Kaname é o líder da Classe Noturna, e a posição de Yuuki no comitê disciplinar permite que ela o veja novamente, fazendo com que seus sentimentos por ele fiquem complicados. Enquanto isso, Zero nutre um ódio ardente por todos os vampiros e acredita que eles nunca poderão viver em harmonia com os humanos. Mas um segredo do passado de Zero logo ameaça a frágil paz de todos na academia, e as coisas podem nunca mais ser as mesmas.