Se fosse realizada uma pesquisa para ver se as pessoas acreditam em alienígenas, viajantes do tempo ou talvez espers, a maioria diria que não; O estudante médio do ensino médio, Kyon, se considera um dos não-crentes. Porém, em seu primeiro dia de aula, ele conhece uma garota que logo vira seu mundo de cabeça para baixo. Durante as apresentações das aulas, a bela Haruhi Suzumiya corajosamente anuncia seu tédio com pessoas “normais” e sua intenção de conhecer seres sobrenaturais. Estupefata, Kyon descobre sua frustração com a falta de clubes com foco paranormal em sua escola e involuntariamente a inspira a começar seu próprio clube. Ela cria a Diversão por todo o mundo com a Brigada Haruhi Suzumiya, também conhecida como Brigada SOS. Após a fundação da Brigada SOS, Haruhi consegue recrutar Kyon e três outros membros: o quieto leitor ávido Yuki Nagato, o tímido veterano Mikuru Asahina e o perpetuamente positivo Itsuki Koizumi. Apesar de sua aparência normal, cada um dos novos membros da Brigada SOS carrega seus próprios segredos relacionados a Haruhi. Apanhado no mistério que rodeia o excêntrico líder do clube, Kyon é levado numa série de desventuras por Haruhi e pela Brigada SOS, cada uma delas aproximando-o da verdade sobre quem e o que ela é.