A segunda etapa do Battle Royale conhecida como Plano Sekirei está em andamento. Shintou Teito foi fechado; nenhum Sekirei ou Ashikabi pode sair. Minato Sahashi e seu harém de Sekirei devem agora se preparar para travar novas batalhas à medida que mudanças nas regras são implementadas. No entanto, nem todos os grupos retornarão à batalha: alguns Sekirei são muito amados pelos seus parceiros Ashikabi, que preferem perder o prêmio a vê-los morrer. No meio da ação, alguém próximo a Minato pode estar mais envolvido do que ele jamais imaginou, e ameaças espreitam em cada esquina. Existem até rumores de que os “Números Únicos”, o tipo mais poderoso de Sekirei, entraram na briga. Aos olhos do “Game Master” Minaka Hiroto, tudo está correndo conforme o planejado.