Para estudantes do ensino médio como Shouichi Kamita, os exames de admissão à universidade e o futuro são preocupações comuns. É também durante esse período da vida que uma emoção misteriosa que incomoda pessoas de todas as idades pode começar a pesar na mente de uma pessoa: o amor. Neste ponto de sua adolescência, Shouichi encontra três garotas com quem ele poderia ter um futuro: a sempre alegre Hikari Tsuneki, que provoca Shouichi sem piedade, mas na verdade tem um lado mais suave; o jogador competitivo Tooru Miyamae, que tem dificuldade de se comunicar com outras pessoas; e a amiga de infância de Shouichi, Kyouko Touno, às vezes imatura entusiasta do shoujo manga. Seiren segue o relacionamento de Shouichi com essas três garotas em três arcos separados, à medida que seus sentimentos crescem a partir do interesse mútuo e florescem em algo mais bonito.