Para o jovem Oz Vessalius, herdeiro da Casa do Duque de Vessalius, o mundo perigoso chamado Abismo nada mais é do que um conto popular usado para assustar crianças malcomportadas. No entanto, quando a cerimônia de maioridade de Oz é interrompida pelo malicioso Clã Baskerville com a intenção de bani-lo para as profundezas do Abismo, o herdeiro Vessalius percebe que sua vida pacífica e luxuosa está no fim. Agora, ele deve enfrentar o mundo do Abismo e seus habitantes, as monstruosas “Chains”, que não são tão falsas quanto ele antes acreditava. Baseado no mangá de fantasia sobrenatural de mesmo nome, Pandora Heartsconta a história da jornada de Oz, de quinze anos, para descobrir o significado por trás dos estranhos acontecimentos que tomaram conta de sua vida. Ajudado por uma misteriosa Chain chamada Alice, cujo apelido é “Bloodstained Black Rabbit”, e por membros de uma organização clandestina conhecida como “Pandora”, Oz começa a perceber que sua existência pode ter mais significado do que ele jamais poderia ter imaginado.