Yukiteru Amano é um estudante tímido do ensino médio que regularmente acompanha o que faz em sua vida diária, anotando todas as suas atividades em seu telefone – um diário digital. Apesar de não ter amigos na escola, Yukiteru é frequentemente visto conversando com seus amigos supostamente imaginários, Deus Ex Machina, o deus do tempo e do espaço; e o servo de Deus, Mur Mur. Um dia, Yukiteru acorda e descobre que certos acontecimentos do seu dia são exibidos preventivamente em seu celular. Embora inicialmente considere isso uma coincidência, ele lentamente percebe que os incidentes escritos em seu telefone realmente acontecerão em um futuro próximo. Depois de passar o dia aproveitando esse novo recurso, Yukiteru descobre que seu colega Yuno Gasai possui um diário semelhante. Enquanto os dois se unem para derrotar um estranho perseguidor e voltam para suas respectivas casas, Deus Ex Machina explica que eles – junto com outros 10 competidores – foram atraídos para um jogo de sobrevivência cujo vencedor se tornará o sucessor da divindade. Sem outras opções, Yukiteru e Yuno devem usar seus celulares – agora chamados de “Diários do Futuro” – para sobreviver a esta implacável batalha real.