A vida de Koushi Nagumo, de 12 anos, de repente piora quando seu pai o abandona depois que sua casa pega fogo. Deixado à própria sorte, Koushi desmaia na rua, mas uma mulher excêntrica chamada Mineru Wachi fica com pena dele e o leva para o dormitório feminino "Megami-ryou". Depois de saber da situação de Koushi, Mineru, que por acaso é o gerente temporário, o convida para se tornar a mãe oficial do dormitório de Megami-ryou. No entanto, o que o espera são os residentes do dormitório - cada um com suas próprias travessuras malucas - como a androfóbica, porém gentil, Atena Saotome, a moleca feminina Kiriya Senshou e a própria Mineru, cuja imprudência não tem limites quando se trata de ciência. Apesar disso, Koushi faz o possível para cumprir os deveres dessa nova vida maluca!