Mizuki Usami é um membro apaixonado do clube de arte de sua escola, mas o clube tem um problema: Usami é o único membro que leva seu trabalho a sério! O preguiçoso presidente do clube dorme constantemente durante as atividades e Collette não participa regularmente das atividades do clube há algum tempo. Uchimaki Subaru, apesar de ser um artista excepcional que poderia ganhar um prêmio se tentasse, é obcecado em desenhar a esposa 2D perfeita. Alegre e com tom cômico, Kono Bijutsubu ni wa Mondai ga Aru! segue Usami enquanto ela luta para realizar atividades semelhantes às de um clube de arte, muitas vezes obstruída por seu grupo heterogêneo de inúteis e sua paixão perturbadora por Subaru.