Macacos supersônicos, vampiros, homens-peixe falantes e todos os tipos de monstros sobrenaturais diferentes que vivem ao lado dos humanos - isso faz parte da vida diária em Hellsalem's Lot, anteriormente conhecida como cidade de Nova York, já há algum tempo. Quando um portal entre a Terra e o Além se abriu há três anos, tanto os nova-iorquinos como as criaturas da outra dimensão ficaram presos numa bolha impenetrável e foram forçados a viver juntos. Libra é uma organização secreta composta por excêntricos e super-humanos, com a tarefa de manter a ordem na cidade e garantir que o caos não se espalhe para o resto do mundo. Seguindo a fotografia como hobby, Leonardo Watch leva uma vida normal com os pais e a irmã. Mas quando ele obtém os "Olhos Que Tudo Vêem dos Deuses" às custas da visão de sua irmã, ele vai para Hellsalem's Lot para ajudá-la, encontrando respostas sobre os poderes misteriosos que recebeu. Ele logo encontra Libra, e quando Leo inesperadamente se junta a eles, ele consegue mais do que esperava. Kekkai Sensen segue as desventuras de Leo no lugar mais estranho da Terra com seus companheiros igualmente estranhos - enquanto o garoto comum, involuntariamente, vê sua vida dar uma guinada para o extraordinário.