Quando um organismo extraterrestre conhecido como “Selvagem” ataca a humanidade, a única tecnologia capaz de combater o inimigo é uma arma conhecida como “Cem”. Sobrevivente de um ataque selvagem, Hayato Kisaragi é um adolescente que ostenta o mais alto nível de compatibilidade com a tecnologia mencionada e, como resultado, é convidado a dominar suas habilidades em Little Garden, uma prestigiada academia militar a bordo de um navio de guerra. Ao longo de seu intenso treinamento para a batalha que está por vir, ele imediatamente atrai o interesse de várias colegas do sexo feminino e se envolve em uma série de incidentes enquanto tenta lutar contra as criaturas que agora habitam a Terra e ameaçam sua segurança.