Na Shinryou Private Academy – uma escola cara para estudantes ricos – nunca se esperaria encontrar o pobre Suigin Riku. Quando ele não está trabalhando em um de seus muitos empregos de meio período para pagar suas mensalidades, muitas vezes ele pode ser encontrado jogando o jogo de RPG Dungeon Century, onde cultivou um relacionamento com um amigo online. No entanto, quando Dungeon Century fecha, ele descobre que sua paixão, o bondoso Rei Riku, e seu amigo online são a mesma pessoa. Mas no rescaldo desta revelação, Rei é sequestrada e levada para Grave Buster, que é um novo jogo online dos criadores de Dungeon Century, forçando Suigin a entrar no duro mundo novo de um jogo pay-to-win para salvar dela. Gin no Guardian 2ª Temporadacontinua a busca de Suigin para resgatar Rei, enquanto tenta resolver os mistérios deste estranho jogo.