Gakusen Toshi Asterisk 2ª temporada continua a história dos alunos de Genestella, Ayato Amagiri e Julis-Alexia von Riessfeld, que avançaram para a próxima rodada da Phoenix Festa após uma longa e árdua batalha com as irmãs Irene e Priscilla Urzaiz. Apesar das melhores tentativas de Julis e Ayato, o fato de os poderes de Ayato terem sido selados não é mais segredo. Agora em grande desvantagem, a dupla deve bolar um plano se quiserem ter alguma esperança de vencer a Festa Fênix. Só uma coisa é certa: os problemas que se avizinham só se tornarão mais intransponíveis daqui em diante.