O turbulento estudante Kaname Chidori e o soldado Sousuke Sagara estão desfrutando de uma vida feliz no ensino médio. No entanto, os seus dias pacíficos são perturbados pela ameaçadora organização terrorista Amalgam. Leonard Testarossa, membro da organização que possui "Whispered", busca adquirir Kaname e seu conhecimento. A batalha de Kaname e Sousuke contra Amalgam começa em sua própria vizinhança, o que eventualmente os leva a uma caçada ao redor do mundo. Das terras exóticas do Laos à árida costa mexicana, Sousuke deve reunir informações para derrubar Amalgam. Enquanto isso, as habilidades de Kaname aumentam, mas sua frustração também aumenta à medida que sua determinação diminui. Envolvidos em um intenso jogo de esconde-esconde, além de tramas estratégicas, a dupla tenta se conectar e ir além de seus próprios limites.