"Era uma vez, as fadas eram ferramentas de guerra." A história se passa em um mundo onde as fadas possuem e habitam animais, dando-lhes habilidades misteriosas. Ao remover os órgãos de um animal possuído e transplantá-los para humanos, as fadas podem ser convocadas como um alter ego e usadas como arma. Esses indivíduos que usavam fadas como ferramentas de guerra eram chamados de “Fadas Soldadas”. Assim que a guerra terminou e eles completaram as suas funções, os soldados perderam o seu propósito. Alguns começaram a trabalhar para o governo, alguns aderiram à máfia e alguns até se tornaram terroristas, pois cada um escolheu a sua maneira de viver. Nove anos se passaram desde a guerra. A protagonista Mariya é uma nova recruta de “Dorothea”, uma organização que investiga e reprime crimes relacionados às fadas. No meio da situação política instável, criminosos com feridas persistentes da guerra e de conflitos passados ​​emergem e praticam o terrorismo como um acto de vingança. Esta é a história de Fairy Soldiers, lutando por sua própria justiça em um mundo caótico do pós-guerra.