Depois de cinco anos nutrindo sentimentos não ditos, o estudante Taiju Ooki está finalmente pronto para confessar seu amor por Yuzuriha Ogawa. Porém, justamente quando Taiju começa sua confissão, uma luz verde ofuscante atinge a Terra e petrifica a humanidade em todo o mundo - transformando cada ser humano em pedra. Vários milênios depois, Taiju desperta e descobre que o mundo moderno é completamente inexistente, já que a natureza floresceu nos anos em que a humanidade parou. Entre um mundo de pedra cheio de estátuas, Taiju encontra outro ser humano vivo: seu amigo Senkuu, amante da ciência, que está ativo há alguns meses. Taiju descobre que Senkuu desenvolveu um grande esquema: lançar o renascimento completo da civilização com a ciência. A força muscular de Taiju e o cérebro de Senkuu se combinam para formar uma parceria formidável, e eles logo descobrem um método para reviver aqueles petrificados. No entanto, o plano mestre de Senkuu é ameaçado quando as suas ideologias são desafiadas por aqueles que despertam. Enquanto isso, a razão da petrificação da humanidade permanece desconhecida.