Subaru Mikazuki é um autor de romances de mistério de 23 anos, muito introvertido e uma pessoa estranhamente tímida. Ele prefere ficar em casa lendo um livro do que sair e interagir com outras pessoas. Para agravar ainda mais esta vida de solidão, seus pais morreram tragicamente em um acidente há muitos anos, deixando-o sozinho no mundo. Um dia, enquanto fazia oferendas no túmulo de seus pais, Subaru encontra um pequeno gato cinza e branco chamado Haru, que acaba levando para casa. Subaru, no entanto, nunca cuidou de mais ninguém em sua vida – ele consegue cuidar de um gato? Haru fica grato a Subaru, pois ele lhe dá toda a comida que ela deseja - um luxo para um gato acostumado a uma vida difícil nas ruas. Mas ela percebe que Subaru não consegue nem cuidar de si mesmo! Ela ficará bem com esse idiota? Doukyonin wa Hiza, Tokidoki, Atama no Ue. conta a história de uma amizade improvável entre um humano e um gato que tentam promover o entendimento um com o outro.