Se não fosse por sua habilidade de controlar a mente e o corpo das pessoas, Yuu Otosaka seria um estudante comum do ensino médio. Embora dure apenas cinco segundos de cada vez, o poder misterioso de Yuu permitiu-lhe trapacear para chegar ao primeiro lugar da classe e entrar em uma escola secundária de prestígio, onde continua com seus atos desonestos. Suas travessuras são eventualmente interrompidas por Nao Tomori – o teimoso presidente do conselho estudantil da Academia Hoshinoumi – que percebe seu engano. Através da coerção, Nao convence Yuu a se transferir para Hoshinoumi e ingressar no conselho estudantil. A Academia Hoshinoumi é secretamente uma instituição criada para adolescentes que possuem habilidades sobrenaturais – com o conselho estudantil servindo como um meio de localizar aqueles que abusam de seus poderes. Com Yuu ajudando a contragosto nos assuntos do conselho, o grupo se propõe a encontrar e proteger novos usuários de habilidades contra danos. No entanto, à medida que investigam as habilidades, suas descobertas os envolvem em questões muito mais complicadas do que jamais poderiam imaginar.