Capitão Tsubasa é a história apaixonante de um estudante do ensino fundamental cujos pensamentos e sonhos giram quase inteiramente em torno do amor pelo futebol. Tsubasa Oozora, de 11 anos, começou a jogar futebol muito jovem e, embora fosse apenas um esporte recreativo para seus amigos, para ele se tornou uma espécie de obsessão. Para realizar seu sonho da melhor maneira possível, Tsubasa se muda com sua mãe para a cidade de Nankatsu, conhecida por seus excelentes times de futebol escolar. Mas embora ele tenha sido facilmente o melhor em sua cidade antiga, Nankatsu tem muito mais concorrência e precisará de toda a sua habilidade e talento para se destacar dessa nova multidão. Ele encontra não apenas rivais, mas também novos amigos, como a linda garota Sanae Nakazawa e o talentoso goleiro Genzo Wakabayashi, que compartilha a mesma paixão de Tsubasa, e provará ser um amigo precioso para ajudá-lo a alcançar seus sonhos. Representar o Japão na Copa do Mundo da FIFA é o maior sonho de Tsubasa, mas será preciso muito mais do que talento para alcançá-lo.