No primeiro dia do ensino médio, Mato Kuroi encontra Yomi Takanashi, uma garota tímida e retraída por quem ela imediatamente se interessa. Mato faz o possível para conversar com Yomi, querendo fazer amizade com ela. A princípio, ela é evitada, mas o gelo quebra quando Yomi percebe um pássaro azul decorativo preso ao telefone de Mato, que faz parte do livro "Li'l Birds At Play". Ao descobrirem que têm um interesse comum, os dois formam uma forte amizade. Em um universo alternativo, as meninas existem como seres paralelos, Mato como Black★Rock Shooter e Yomi como Dead Master. De alguma forma, o que acontece em um mundo parece ter efeito no outro, e sem saber disso, as meninas, sem saber, ficam enredadas nos fios do destino.