Há dez anos, uma erupção vulcânica levou as ilhas Ayaka, no Japão, à beira da destruição. Desde então, Yukito Yanagi vive com famílias adotivas no continente, mas isolou-se dos outros após um incidente perturbador. Devido aos desejos de seu falecido pai, Makoto, Yukito é trazido de volta à sua cidade natal no dia de sua formatura no ensino médio. Lá ele conhece os discípulos de Makoto e aprende sobre o estado sobrenatural da região. Formas de vida misteriosas conhecidas como Mitama habitam as ilhas, mas o seu potencial para se alimentar da energia negativa dos humanos e se transformar em monstros ferozes chamados Ara-Mitama põe em perigo a vida dos ilhéus. Yukito descobre que, assim como seu pai, ele é um Ley Master – um indivíduo especial com habilidades semelhantes à magia, encarregado de pacificar os Ara-Mitama. À medida que aprende a superar seu trauma e controlar seus poderes, Yukito decide seguir os passos de seu pai e se tornar um Ley Master de primeira linha para proteger a paz de Ayaka.