Há cinquenta anos, criaturas misteriosas conhecidas como “Enormes” apareceram de repente em todo o mundo, representando uma ameaça existencial para a humanidade. Para se defenderem contra essas ameaças, os soldados na forma de adolescentes conhecidas como "Lírios" usam a energia "Magie" dentro de seus corpos para alimentar armas chamadas "Counter Huge ARMS" ou "CHARMS". Depois de ser salva por uma Lily há dois anos, enquanto evacuava de um ataque enorme, Riri Hitotsuyanagi jurou se tornar uma Lily. Ela se matricula na prestigiada academia de Yurigaoka, um campo de treinamento para Lilies, e descobre que um de seus colegas de classe é Yuyu Shirai – a mesma Lily que a resgatou. Para sua confusão, porém, a pessoa que ela considerava alegre acaba sendo bastante anti-social e prefere lutar sozinha. Mesmo assim, Riri ainda deseja se dar bem com Yuyu e está disposta a fazer tudo o que puder para alcançar esse objetivo. Com Yuyu e os outros Lírios ao seu lado, a jornada de Riri para se tornar um deles acaba de florescer!