Há cinquenta anos, criaturas horríveis apelidadas de “inimigos da humanidade” apareceram de repente em todo o mundo. Para combater essas ameaças, adolescentes dotados de habilidades sobrenaturais chamadas "Talentos" - como pirocinese e viagem no tempo - aprimoram seus poderes em uma academia em uma ilha isolada. Nanao Nakajima, porém, é bem diferente dos demais da ilha: não tem Talento. Com muitos adolescentes “talentosos” ao seu redor, Nanao costuma ser alvo de bullying, mas mesmo assim, ele ainda se esforça para completar seu treinamento. Logo depois, dois alunos transferidos, a misteriosa Kyouya Onodera e a leitora de mentes Nana Hiiragi, juntam-se à turma. Mas assim que todos começam a se misturar como camaradas de armas, desaparecimentos misteriosos começam a ameaçar toda a base da classe.