Num dia calmo e pacífico, os céus se abrem e seres extradimensionais, designados como o Desconhecido, lançam um ataque rápido e brutal contra a humanidade. Para proteger o futuro do país, todas as crianças do Japão são congeladas criogenicamente até ao fim da guerra para mantê-las fora de perigo. Vários anos se passam e a humanidade estabeleceu uma posição segura num canto do Japão, que agora serve como linha de frente da guerra. Não enfrentando mais a extinção da humanidade, as crianças são despertadas do seu sono. Descobre-se então que, durante a criogênese, as crianças desenvolveram Mundos, poderes sobrenaturais únicos para cada pessoa. As seis crianças mais poderosas recebem o comando das cidades recuperadas, usando os seus poderes para defender as fortalezas contra a invasão contínua. Os amigos de infância Ichiya Suzaku e Canaria Utara lideram Tóquio, os irmãos Kasumi e Asuha Chigusa administram Chiba e Maihime Tenkawa e Hotaru Rindou supervisionam Kanagawa. Com o tempo, os ataques quase rotineiros do Desconhecido e as personalidades conflitantes dos chefes e subchefes das cidades cultivam rivalidades mesquinhas, levando a discussões constantes entre as três cidades. Com o Desconhecido aumentando repentinamente a pressão dos seus ataques, os líderes das três cidades devem aprender como trabalhar juntos ou correm o risco de perder a última linha de defesa contra a extinção da humanidade.