Depois que o pai de Koutarou Satomi é repentinamente transferido para trabalhar, o estudante do primeiro ano do ensino médio se depara com a necessidade de encontrar um lugar barato para morar sozinho. Naturalmente, ele aproveita a oportunidade de se mudar para o quarto 106 da Corona House por apenas cinco mil ienes por mês. Mas embora tudo corra bem no início, Koutarou logo consegue muito mais do que esperava depois de tropeçar em uma caverna misteriosa enquanto trabalhava em seu emprego de meio período. Na noite seguinte, Koutarou é visitado por várias figuras aparentemente míticas, todas reivindicando a propriedade do apartamento do pobre estudante. Entre os invasores estão Sanae Higashihongan, um fantasma que supostamente assombra a sala, a garota mágica Yurika, a princesa alienígena Theiamillis Gre Fortorthe e Kiriha Kurano, uma descendente direta do Povo da Terra. Mas o mais importante é que cada uma dessas quatro garotas precisa do apartamento de Koutarou por seus próprios motivos e não desistirá sem lutar! Rokujouma no Shinryakusha!? é uma batalha real cômica sobre um apartamento de seis tatames envolvendo seres sobrenaturais, travessuras românticas no ensino médio e uma senhoria aparentemente cordial.